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illumina二代測序儀

更新時間╃✘:2022-06-12

簡要描述╃✘:

illumina二代測序儀MiSeq系統可透過各種測序應用為您的研究提供便利☁↟。它能夠自動生成雙端read☁₪,每次執行的產出高達15 Gb☁₪,每條read可提供600多個鹼基的測序資料☁↟。它使用的文庫製備試劑盒已針對多種應用進行了最佳化☁₪,包括靶向基因測序│₪₪↟、小型基因組測序│₪₪↟、擴增子測序│₪₪↟、16S宏基因組學等☁↟。

Illumina公司推出MiSeq是一臺在單個儀器上整合了擴增│₪₪↟、測序和資料分析的新款測序儀☁₪,每次執行能產生超過1Gb的資料☁₪,且佔地面積僅為2平方英尺☁↟。MiSeq的流程和準確性☁₪,讓它成為快速且經濟的遺傳分析的理想平臺☁₪,適合廣泛的應用☁↟。同時Illumina已被FDA大量採購並即將透過FDA認證☁₪,12年10月☁₪,MiSeq系統的測序通量已升級至8G左右☁↟。升級透過兩個方面完成☁₪,一個是cluster密度的增大☁₪,升級後cluster密度增加至15-17million☁₪,而pair-end讀取的reads數目將會增加至30-34million;另一方面是透過測序讀長而提升通量☁₪,測序讀長達到2*300bp☁₪,同時測序速度也有所提升☁↟。目前☁₪,Broad研究院已經利用現有試劑實現了單端測序300bp讀長☁₪,Illumina目前內部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序☁↟。而這些☁₪,都是保證在高質量資料結果的前提下完成的☁↟。


MiSeq效能引數


Illumina MiSeq測序時間和資料量


讀長(bp)時間總資料量Q30
1×36~4 hrs540-610 Mb﹥90%
2×25~5.5 hrs750-850 Mb﹥90%
2×100~16.5 hrs3.0-3.4 Gb﹥85%
2×150~24 hrs4.5-5.1 Gb﹥80%
2×250~39 hrs7.5-8.5 Gb﹥70%



Illumina MiSeq讀取量比對


執行型別透過過濾的讀取(百萬)
升級前升級後
單端讀取5-7 M15-17 M
末端配對讀取10-14 M30-34 M


工作流程


illumina二代測序儀 MiSeq四大特性

1│₪₪↟、較短的實驗週期╃✘:從樣品製備開始需要8小時即可得到超過100M的高質量測序結果☁↟。

2│₪₪↟、便捷的樣品製備流程╃✘:需50ngDNA模板☁₪,2小時的自動化操作就可以完成全部樣品製備工作☁↟。

3│₪₪↟、測序原理╃✘:MiSeq繼續GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學原理☁↟。

4│₪₪↟、完整的整合功能╃✘:MiSeq可以獨立完成簇生成☁₪,雙向測序及資料分析工作☁₪,讓經費和實驗室空間不再成為NGS研究的障礙☁↟。


illumina二代測序儀 MiSeq應用範圍

1│₪₪↟、轉錄組測序

派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉錄組分析平臺☁↟。公司技術團隊目前已完成了包括斑馬魚在內的多種植物│₪₪↟、動物的轉錄組測序及分析☁↟。


2│₪₪↟、宏基因組16S rDNA單V區測序

對16s rDNA的單V區(V3\V4)進行高通量測序☁₪,鑑定細菌群和古生菌群☁↟。派森諾的技術團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區並結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區成功的對雞的腸道環境細菌進行了鑑定☁↟。


3│₪₪↟、Small RNA測序

1*35bp的讀長配合了小RNA的測序長度☁₪,速度快☁₪,靈敏度高☁↟。派森諾的技術團隊目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序☁↟。


4│₪₪↟、重測序╃✘:包括全基因組重測序│₪₪↟、簡化基因組測序│₪₪↟、外顯子測序☁↟。

Illumina MiSeq非常適用於對微生物基因組的重測序☁₪,每次執行即可完成一個微生物基因組測序☁↟。2011年12月27日☁₪,派森諾的技術團隊利用MiSeq一次運行同時完成了乳酸菌(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重測序☁₪,基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍☁₪,比對至參考序列☁₪,基因組實現全覆蓋☁₪,同時檢測到了多種結構變異☁₪,包括插入│₪₪↟、缺失和SNP位點☁₪,並且檢測到了全部質粒☁↟。


資料展示

* 以上產品介紹及資料來源於Illumina☁₪,僅供參考☁₪,以Illumina為準☁↟。



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